MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020934	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449526
2	NC_020934	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478449526
3	NC_020934	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449526
4	NC_020934	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
5	NC_020934	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478449526
6	NC_020934	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
7	NC_020934	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449526
8	NC_020934	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
9	NC_020934	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449526
10	NC_020934	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478449526
11	NC_020934	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449526
12	NC_020934	GCT	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449526
13	NC_020934	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478449526
14	NC_020934	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449526
15	NC_020934	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478449526
16	NC_020934	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478449526
17	NC_020934	TGC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449526
18	NC_020934	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449526
19	NC_020934	CGA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449526
20	NC_020934	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449526
21	NC_020934	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478449526
22	NC_020934	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
23	NC_020934	AGA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
24	NC_020934	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449526
25	NC_020934	CAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449526
26	NC_020934	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478449526
27	NC_020934	TTG	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449526
28	NC_020934	CTC	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449526
29	NC_020934	GAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
30	NC_020934	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
31	NC_020934	GAAGGA	2	12	1357	1368	50 %	0 %	50 %	0 %	478449526
32	NC_020934	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449526
33	NC_020934	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478449526
34	NC_020934	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449526
35	NC_020934	CAG	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449526
36	NC_020934	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449527
37	NC_020934	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449527
38	NC_020934	TCC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449527
39	NC_020934	AGC	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449527
40	NC_020934	T	6	6	1981	1986	0 %	100 %	0 %	0 %	478449527
41	NC_020934	AGC	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449527
42	NC_020934	AAG	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449527
43	NC_020934	TAC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449527
44	NC_020934	GCT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449527
45	NC_020934	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478449527
46	NC_020934	AAC	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449527
47	NC_020934	AGA	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449527
48	NC_020934	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449528
49	NC_020934	ATC	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449528
50	NC_020934	TGC	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449528
51	NC_020934	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478449528
52	NC_020934	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478449528
53	NC_020934	CAT	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449528
54	NC_020934	AGA	2	6	2594	2599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449528
55	NC_020934	AAG	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449528
56	NC_020934	GGA	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449528
57	NC_020934	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478449529
58	NC_020934	ATC	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449529
59	NC_020934	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478449529
60	NC_020934	ATA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449529
61	NC_020934	AAC	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449529
62	NC_020934	GGT	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449529
63	NC_020934	AAT	2	6	3122	3127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449529
64	NC_020934	TTC	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449529
65	NC_020934	GCA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
66	NC_020934	GGA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449529
67	NC_020934	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
68	NC_020934	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449529
69	NC_020934	GGT	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449529
70	NC_020934	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478449529
71	NC_020934	T	6	6	3425	3430	0 %	100 %	0 %	0 %	478449529
72	NC_020934	AAG	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
73	NC_020934	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449529
74	NC_020934	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449529
75	NC_020934	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478449529
76	NC_020934	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
77	NC_020934	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
78	NC_020934	CAG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
79	NC_020934	GCT	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449529
80	NC_020934	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478449529
81	NC_020934	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478449529
82	NC_020934	AAG	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449529
83	NC_020934	CAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449529
84	NC_020934	GGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449529
85	NC_020934	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449529
86	NC_020934	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478449530
87	NC_020934	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449530
88	NC_020934	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449530
89	NC_020934	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478449530
90	NC_020934	GTA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449530
91	NC_020934	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478449530
92	NC_020934	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449530
93	NC_020934	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478449530
94	NC_020934	GAA	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449530
95	NC_020934	CGT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449530
96	NC_020934	A	7	7	4925	4931	100 %	0 %	0 %	0 %	478449530
97	NC_020934	GTT	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449530
98	NC_020934	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478449530
99	NC_020934	A	7	7	4971	4977	100 %	0 %	0 %	0 %	478449530
100	NC_020934	TGA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449530
101	NC_020934	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478449530
102	NC_020934	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478449530
103	NC_020934	TTG	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449530
104	NC_020934	TTC	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449530
105	NC_020934	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449530
106	NC_020934	AGA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449530
107	NC_020934	GTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449530
108	NC_020934	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478449530
109	NC_020934	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449530
110	NC_020934	AAAGCT	2	12	5538	5549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478449530
111	NC_020934	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478449530
112	NC_020934	CTC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449530
113	NC_020934	AGC	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449530
114	NC_020934	ATT	2	6	5746	5751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449531
115	NC_020934	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449531
116	NC_020934	GCT	2	6	5810	5815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449531
117	NC_020934	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478449531
118	NC_020934	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449531
119	NC_020934	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478449531
120	NC_020934	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478449531
121	NC_020934	ACG	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449531
122	NC_020934	GAA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
123	NC_020934	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478449531
124	NC_020934	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478449531
125	NC_020934	AGA	3	9	5984	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
126	NC_020934	GCT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449531
127	NC_020934	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
128	NC_020934	TGG	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449531
129	NC_020934	AGA	3	9	6056	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449531
130	NC_020934	GGA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449531
131	NC_020934	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478449531
132	NC_020934	T	6	6	6207	6212	0 %	100 %	0 %	0 %	478449531
133	NC_020934	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449531
134	NC_020934	GGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449531
135	NC_020934	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478449531
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263	NC_020934	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478449538
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397	NC_020934	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478449544
398	NC_020934	TGC	2	6	20979	20984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449544
399	NC_020934	A	8	8	20988	20995	100 %	0 %	0 %	0 %	478449544
400	NC_020934	A	6	6	21004	21009	100 %	0 %	0 %	0 %	478449544
401	NC_020934	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478449545
402	NC_020934	A	6	6	22111	22116	100 %	0 %	0 %	0 %	478449545
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